Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm8662-201ENSMUST00000118644 574 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
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Hoxd9P28357 Gm15060-201ENSMUST00000119550 948 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm14707-201ENSMUST00000152793 398 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Mgst2-206ENSMUST00000161590 481 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm7316-201ENSMUST00000165395 445 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm5929-201ENSMUST00000166883 487 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm23639-201ENSMUST00000175078 132 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm5709-201ENSMUST00000177879 1165 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm26959-201ENSMUST00000182376 978 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm27238-201ENSMUST00000185180 417 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm28739-201ENSMUST00000185415 696 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm29259-201ENSMUST00000186396 694 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm28983-201ENSMUST00000186685 614 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm28114-201ENSMUST00000187232 379 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm28150-201ENSMUST00000187305 614 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm28949-201ENSMUST00000187805 696 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm28483-201ENSMUST00000189519 696 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm28377-201ENSMUST00000189695 720 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 1700063A18Rik-201ENSMUST00000190901 356 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm7369-201ENSMUST00000192738 936 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm32347-201ENSMUST00000192944 696 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm37273-201ENSMUST00000195132 539 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm43624-201ENSMUST00000197368 180 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 2010309G21Rik-201ENSMUST00000198927 458 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm2505-201ENSMUST00000200413 825 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm31663-202ENSMUST00000208481 1190 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm7394-201ENSMUST00000209138 1032 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm45479-201ENSMUST00000211613 802 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
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Hoxd9P28357 Gm2829-201ENSMUST00000213121 499 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 4930579P08Rik-201ENSMUST00000218193 1227 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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Hoxd9P28357 AC110176.1-201ENSMUST00000226219 504 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Tex36-201ENSMUST00000033275 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 1700102P08Rik-201ENSMUST00000035234 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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Hoxd9P28357 Gm1604a-201ENSMUST00000097422 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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Hoxd9P28357 Olfr1111-203ENSMUST00000216378 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
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Hoxd9P28357 Plch1-209ENSMUST00000161052 1472 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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Hoxd9P28357 Cxcl9-201ENSMUST00000113093 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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Hoxd9P28357 Acod1-201ENSMUST00000022722 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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Hoxd9P28357 Kng1-201ENSMUST00000023589 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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Hoxd9P28357 4930503E14Rik-201ENSMUST00000100688 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Igkv8-21-201ENSMUST00000103387 382 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
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Hoxd9P28357 Gm15126-201ENSMUST00000118631 833 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm6877-201ENSMUST00000119347 1101 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
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Hoxd9P28357 Gm11708-201ENSMUST00000119530 832 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Cbx5-203ENSMUST00000122182 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 n-R5s207-201ENSMUST00000122497 118 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm16346-201ENSMUST00000129158 937 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm15788-201ENSMUST00000130123 613 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Zfp965-204ENSMUST00000143490 297 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm24438-201ENSMUST00000157893 115 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm24534-201ENSMUST00000157949 291 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm17732-201ENSMUST00000163259 821 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm8439-201ENSMUST00000171482 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Mir7058-201ENSMUST00000184637 75 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm29284-201ENSMUST00000188363 255 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm28954-201ENSMUST00000190031 437 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm28072-202ENSMUST00000190486 352 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Ighv1-17-201ENSMUST00000194435 350 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm31942-202ENSMUST00000195375 437 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm43973-201ENSMUST00000203562 210 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
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