Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Gm12465-201ENSMUST00000118591 300 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm13818-201ENSMUST00000119441 511 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm12998-201ENSMUST00000122445 789 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm13184-201ENSMUST00000149932 626 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm16102-201ENSMUST00000160955 420 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Vmn1r94-201ENSMUST00000164526 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm4216-201ENSMUST00000168926 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Vmn1r142-201ENSMUST00000169697 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Klrb1a-202ENSMUST00000171306 989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 n-R5s209-201ENSMUST00000179494 119 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Rpl31-ps23-201ENSMUST00000180440 388 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Olfr1055-202ENSMUST00000188023 939 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm29516-201ENSMUST00000190402 468 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm38291-201ENSMUST00000193671 259 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm37758-201ENSMUST00000194275 629 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm18747-201ENSMUST00000198129 648 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm45044-201ENSMUST00000208078 396 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 4930558N11Rik-203ENSMUST00000211456 1180 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 CT009748.2-201ENSMUST00000213828 1082 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 AC151904.3-201ENSMUST00000219266 895 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm40394-201ENSMUST00000221321 633 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 AC131187.2-201ENSMUST00000223936 994 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 AC192088.2-201ENSMUST00000227590 411 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm22300-201ENSMUST00000082661 126 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm39327-201ENSMUST00000213594 1982 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Mbtd1-204ENSMUST00000107852 1930 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 AC154612.1-202ENSMUST00000224806 1725 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Zscan4d-201ENSMUST00000067210 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Pde6aP27664 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Pde6aP27664 Stk36-203ENSMUST00000113694 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Pde6aP27664 Gm14375-201ENSMUST00000119490 855 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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Pde6aP27664 Vmn1r226-201ENSMUST00000061756 897 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 n-R5s180-201ENSMUST00000082770 106 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Vmn1r132-201ENSMUST00000098736 894 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 4933403O08Rik-202ENSMUST00000152343 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Stk3-205ENSMUST00000226555 2730 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 AF366264-201ENSMUST00000071308 3157 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm34921-201ENSMUST00000219528 1406 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Mad2l1-202ENSMUST00000116605 7557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Olfr1275-202ENSMUST00000216421 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 AC151904.4-201ENSMUST00000219868 1319 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Zfp457-201ENSMUST00000049705 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Lingo2-203ENSMUST00000108122 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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