Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Lemd1-209ENSMUST00000191418 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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Ggta1P23336 4930519H02Rik-202ENSMUST00000198907 968 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Gm38562-201ENSMUST00000199398 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Gm39119-201ENSMUST00000208466 951 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 AC163032.1-201ENSMUST00000220671 2970 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Mir3068-201ENSMUST00000083004 136 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Ankrd34c-201ENSMUST00000060700 5457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Matr3-ps2-201ENSMUST00000160839 1996 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
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Ggta1P23336 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Olfr536-204ENSMUST00000215340 3938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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Ggta1P23336 Dclre1c-204ENSMUST00000115066 3828 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Gm43360-201ENSMUST00000197656 2887 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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Ggta1P23336 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Epyc-202ENSMUST00000105285 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Slc22a29-201ENSMUST00000113298 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 P2ry12-201ENSMUST00000050360 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 AC134329.1-201ENSMUST00000217956 1770 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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Ggta1P23336 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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Ggta1P23336 Gm12094-201ENSMUST00000121781 472 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 4930586N03Rik-201ENSMUST00000122940 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Gstm2-201ENSMUST00000012348 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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Ggta1P23336 Bloc1s6os-201ENSMUST00000150154 696 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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Ggta1P23336 Gm23995-201ENSMUST00000158060 129 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Wfdc15b-203ENSMUST00000164567 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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Ggta1P23336 Rpain-213ENSMUST00000178822 566 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 1810053B23Rik-201ENSMUST00000185242 634 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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Ggta1P23336 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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Ggta1P23336 AV320801-201ENSMUST00000068340 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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Ggta1P23336 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
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Ggta1P23336 Zfp473-203ENSMUST00000120074 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 9330159M07Rik-201ENSMUST00000180712 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Gm42715-201ENSMUST00000189629 12746 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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Ggta1P23336 Ighv1-39-201ENSMUST00000103515 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Gm10936-201ENSMUST00000105264 252 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Prdx2-rs3-201ENSMUST00000117259 594 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.6 ms