Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 4933424M12Rik-202ENSMUST00000203451 1100 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Gm44559-201ENSMUST00000207177 1012 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Gm19116-201ENSMUST00000218592 642 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 AC174082.2-201ENSMUST00000222094 543 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 AC129537.1-201ENSMUST00000226596 1228 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Psg20-201ENSMUST00000076677 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Vaultrc5-201ENSMUST00000083211 143 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Sult2a3-201ENSMUST00000098809 1018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Mef2c-212ENSMUST00000197146 6088 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 C230085N15Rik-201ENSMUST00000194893 4327 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Vmn1r34-206ENSMUST00000228498 3078 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Hsp90aa1-201ENSMUST00000021698 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Gm37894-201ENSMUST00000195416 2599 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Olfr1204-202ENSMUST00000213283 6935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Olfr350-203ENSMUST00000215100 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Gm7108-201ENSMUST00000118038 3407 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Mef2c-202ENSMUST00000163888 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Phyhipl-206ENSMUST00000162251 1540 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Gm11346-204ENSMUST00000149751 2893 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Herc1-201ENSMUST00000042824 15153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Ankrd34c-201ENSMUST00000060700 5457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Ighv1-26-201ENSMUST00000103510 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Gm14510-201ENSMUST00000116165 1092 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Gm12262-201ENSMUST00000119915 305 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Gm15596-201ENSMUST00000121139 784 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Gm12399-201ENSMUST00000121475 446 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Gm4152-201ENSMUST00000172675 259 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 1700029M03Rik-202ENSMUST00000187517 357 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Gm37173-201ENSMUST00000194498 1017 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Gm18985-201ENSMUST00000196472 1079 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Gm43243-201ENSMUST00000199964 278 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Gm33501-201ENSMUST00000209257 1193 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Olfr931-ps1-201ENSMUST00000214941 549 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Gm35188-201ENSMUST00000218869 535 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Cst12-201ENSMUST00000028932 644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Olfr971-201ENSMUST00000075467 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Rps19-ps4-201ENSMUST00000091925 438 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Vmn1r11-202ENSMUST00000226968 2522 ntAPPRIS P2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 BC018473-204ENSMUST00000156293 4753 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Kmt2d-201ENSMUST00000023741 19823 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Mbd3l2-201ENSMUST00000051008 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Bicd1-201ENSMUST00000003544 2928 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Sspn-202ENSMUST00000111701 4512 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Atr-213ENSMUST00000215311 8102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Tet2-201ENSMUST00000098603 9179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Fat4-201ENSMUST00000061260 16109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Olfr657-202ENSMUST00000213297 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Gm22231-201ENSMUST00000101027 73 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Gm14819-201ENSMUST00000101645 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Ighv1-18-201ENSMUST00000103504 306 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Pou5f1P20263 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms