Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 AC113204.1-202ENSMUST00000219846 578 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 AC152979.4-201ENSMUST00000219893 379 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 CT010472.1-201ENSMUST00000224000 704 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 AC154487.1-201ENSMUST00000224649 226 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Olfr790-201ENSMUST00000056002 1070 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Cysltr1-201ENSMUST00000064892 1059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm9964-201ENSMUST00000068448 728 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Olfr743-201ENSMUST00000071294 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Bglap3-201ENSMUST00000075523 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Vmn1r202-201ENSMUST00000078642 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 4930524N10Rik-201ENSMUST00000082357 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Olfr831-ps1-201ENSMUST00000086496 890 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm6419-201ENSMUST00000097166 429 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Adgrl2-202ENSMUST00000106128 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Slc22a26-201ENSMUST00000065634 2007 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Clasp1-212ENSMUST00000189262 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Aadat-202ENSMUST00000209338 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Olfr969-202ENSMUST00000213266 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Cfap221-201ENSMUST00000037840 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm43376-202ENSMUST00000199747 1743 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm14849-201ENSMUST00000122293 2846 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Pdgfd-203ENSMUST00000214892 2862 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 CT010577.1-202ENSMUST00000226187 1903 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm36527-201ENSMUST00000195500 3029 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Olfr350-203ENSMUST00000215100 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Frmd7-201ENSMUST00000060650 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm43588-201ENSMUST00000201862 2298 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Tex14-201ENSMUST00000060835 4763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm24869-201ENSMUST00000104072 128 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Celf2-203ENSMUST00000114923 529 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm14981-201ENSMUST00000117325 943 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm14365-201ENSMUST00000117535 587 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm12024-201ENSMUST00000118819 1253 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm14930-201ENSMUST00000118864 652 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm12433-201ENSMUST00000119659 255 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Olfr1374-ps1-201ENSMUST00000120114 936 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm11260-201ENSMUST00000121163 942 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm14826-201ENSMUST00000121284 901 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gimap6-203ENSMUST00000126422 425 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm9785-202ENSMUST00000144563 593 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm15915-201ENSMUST00000147379 908 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm12414-201ENSMUST00000150794 494 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Snora81-201ENSMUST00000157310 178 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm22206-201ENSMUST00000158612 116 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm5611-201ENSMUST00000164523 852 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm22702-201ENSMUST00000175372 69 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm21006-201ENSMUST00000196930 667 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm43368-201ENSMUST00000200638 409 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm44418-201ENSMUST00000204219 705 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm20670-201ENSMUST00000206468 338 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm45042-201ENSMUST00000207377 211 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm45064-201ENSMUST00000208619 443 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm8077-201ENSMUST00000209221 1024 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm45604-201ENSMUST00000209665 550 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm45299-201ENSMUST00000210199 420 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm34853-201ENSMUST00000211662 509 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm8106-201ENSMUST00000213123 523 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Mbd3l1-202ENSMUST00000213625 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Olfr989-ps1-201ENSMUST00000214405 912 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 AC165292.1-201ENSMUST00000215218 620 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm19047-201ENSMUST00000220922 1099 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm40658-203ENSMUST00000222210 1070 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Diaph3-204ENSMUST00000226254 682 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 AC133203.2-201ENSMUST00000226709 464 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 AC154640.3-201ENSMUST00000227492 846 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Olfr1364-201ENSMUST00000057453 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm24921-201ENSMUST00000083024 107 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm24411-201ENSMUST00000083428 131 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm24254-201ENSMUST00000083702 104 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Olfr18-201ENSMUST00000086473 1156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Olfr1162-201ENSMUST00000099837 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Parp6-202ENSMUST00000050483 2631 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm16294-201ENSMUST00000070382 1459 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm11934-201ENSMUST00000132553 1536 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Kynu-203ENSMUST00000112826 1587 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm13230-201ENSMUST00000120870 1575 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm5286-201ENSMUST00000159524 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Malat1-201ENSMUST00000172812 6983 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm9732-202ENSMUST00000163912 1757 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm11855-201ENSMUST00000121562 1869 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Cxcr6-201ENSMUST00000049810 1897 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
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