Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 1700102P08Rik-201ENSMUST00000035234 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm6419-201ENSMUST00000097166 429 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm43169-201ENSMUST00000199544 4734 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Acvr1c-202ENSMUST00000100085 4289 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm38137-201ENSMUST00000193735 1401 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Olfr1275-202ENSMUST00000216421 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Vmn1r171-202ENSMUST00000226128 3063 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm37773-201ENSMUST00000194141 2120 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm13346-201ENSMUST00000135767 3634 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm44750-201ENSMUST00000206185 2223 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm16513-202ENSMUST00000201663 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 AC167013.5-201ENSMUST00000227597 2947 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 4930563J15Rik-201ENSMUST00000218306 3468 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm5751-201ENSMUST00000115561 444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm15765-201ENSMUST00000118407 910 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm13998-201ENSMUST00000120952 335 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm15786-201ENSMUST00000121079 450 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm12322-201ENSMUST00000121605 389 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm15740-201ENSMUST00000159703 1292 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Plac1-203ENSMUST00000174390 907 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm44370-201ENSMUST00000175436 112 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm21839-201ENSMUST00000179536 378 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm40348-201ENSMUST00000199648 452 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm34350-201ENSMUST00000208898 481 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm40653-202ENSMUST00000222122 1155 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 AC137902.1-201ENSMUST00000228184 102 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 AC135086.1-201ENSMUST00000228621 817 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 1810024B03Rik-201ENSMUST00000056146 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Olfr1431-201ENSMUST00000072316 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Homer1-205ENSMUST00000109492 1533 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gabrb2-205ENSMUST00000192403 1539 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 AC107232.1-201ENSMUST00000227785 1503 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm42873-201ENSMUST00000196110 1726 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Olfr1500-205ENSMUST00000216287 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Zfp27-205ENSMUST00000162592 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Brinp3-201ENSMUST00000074622 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Lama2-207ENSMUST00000189575 4244 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Olfr318-203ENSMUST00000214728 4552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Rlf-203ENSMUST00000168615 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Slamf6-207ENSMUST00000195656 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Ptprd-218ENSMUST00000174180 5694 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Cntn1-201ENSMUST00000000109 5646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Mug2-201ENSMUST00000081777 4579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 AC122263.1-201ENSMUST00000228636 2805 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 P2ry12-201ENSMUST00000050360 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 AU023762-203ENSMUST00000209897 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm14391-204ENSMUST00000109058 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Olfr361-201ENSMUST00000100145 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm15400-201ENSMUST00000118944 601 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm14842-201ENSMUST00000119577 269 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Olfr213-201ENSMUST00000121958 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Vmn1r239-ps-201ENSMUST00000127465 960 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm23207-201ENSMUST00000158665 102 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm4152-201ENSMUST00000172675 259 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm29206-201ENSMUST00000189321 827 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm29626-202ENSMUST00000191517 425 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm2367-201ENSMUST00000192374 472 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm37716-201ENSMUST00000193553 947 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Ighv1-73-201ENSMUST00000197435 352 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm32591-202ENSMUST00000204063 403 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm44163-201ENSMUST00000205140 475 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Olfr396-ps1-202ENSMUST00000205791 633 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm44940-201ENSMUST00000206225 1247 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Ifitm6-203ENSMUST00000211330 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 AC108401.2-201ENSMUST00000220316 346 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm34165-201ENSMUST00000222012 1174 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm31063-201ENSMUST00000222636 580 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Rps11-ps4-201ENSMUST00000062226 474 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Bglap-201ENSMUST00000076048 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Magea6-201ENSMUST00000076986 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm24200-201ENSMUST00000082955 157 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Fpr-rs6-201ENSMUST00000095636 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms