Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Asb15-202ENSMUST00000117688 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Gm46136-202ENSMUST00000217053 6329 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Gm14496-201ENSMUST00000071760 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Olfr616-202ENSMUST00000214806 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Taf13-204ENSMUST00000143054 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 BC055402-201ENSMUST00000190488 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Tdrd3-203ENSMUST00000169504 5280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Ubr4-212ENSMUST00000165860 15798 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Gm14382-201ENSMUST00000117374 437 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Gm4914-201ENSMUST00000119757 459 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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H2-Q1O19441 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Gm12514-202ENSMUST00000150455 699 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Gm23386-201ENSMUST00000158585 144 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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H2-Q1O19441 Lrrc4-202ENSMUST00000171353 883 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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H2-Q1O19441 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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H2-Q1O19441 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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H2-Q1O19441 Gm4070-201ENSMUST00000106766 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Gvin1-201ENSMUST00000006667 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Vmn2r97-201ENSMUST00000168710 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Gm16092-201ENSMUST00000161449 2405 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Olfr1353-201ENSMUST00000039718 1992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Gm20356-201ENSMUST00000193390 2477 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Olfr25-202ENSMUST00000212354 1362 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Asap1-205ENSMUST00000175793 4314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Ska2-201ENSMUST00000020794 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Gm13977-201ENSMUST00000133648 4049 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 9330159M07Rik-201ENSMUST00000180712 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Vmn2r-ps119-201ENSMUST00000177481 2406 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Gm37703-201ENSMUST00000192292 1784 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Tex48-201ENSMUST00000102861 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Trbv13-2-201ENSMUST00000103270 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
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