Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Gm6581-201ENSMUST00000214545 260 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 AC166078.1-201ENSMUST00000217211 584 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 AC127224.1-201ENSMUST00000218094 453 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm2398-201ENSMUST00000218347 883 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm18026-201ENSMUST00000222789 727 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 4930474N09Rik-201ENSMUST00000223511 1176 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 3300002A11Rik-201ENSMUST00000046994 654 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Olfr1262-201ENSMUST00000061701 1024 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Olfr352-201ENSMUST00000065416 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Olfr801-201ENSMUST00000072063 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Olfr68-201ENSMUST00000072513 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Olfr1051-201ENSMUST00000099898 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 CT025566.1-202ENSMUST00000224800 2511 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Vmn1r79-202ENSMUST00000226953 5636 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Atp1a4-201ENSMUST00000111243 3470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm45601-201ENSMUST00000211483 6753 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm18701-201ENSMUST00000188281 1536 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 AC134917.1-201ENSMUST00000220517 1449 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Obox6-201ENSMUST00000108513 1344 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm44000-201ENSMUST00000205038 1478 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm38374-201ENSMUST00000194417 2033 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Cyp2j11-201ENSMUST00000015368 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 4930522H14Rik-202ENSMUST00000102725 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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Gm2035J3QP87 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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Gm2035J3QP87 Gm24517-201ENSMUST00000122560 107 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm3173-203ENSMUST00000166848 396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm8267-202ENSMUST00000169062 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Vmn1r1-201ENSMUST00000169123 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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Gm2035J3QP87 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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Gm2035J3QP87 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm26652-202ENSMUST00000181672 475 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm27236-201ENSMUST00000184147 442 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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Gm2035J3QP87 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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Gm2035J3QP87 Sly-201ENSMUST00000189109 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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Gm2035J3QP87 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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Gm2035J3QP87 5033403H07Rik-202ENSMUST00000198248 756 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm8539-201ENSMUST00000199822 501 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 CU024910.1-201ENSMUST00000214310 418 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm26797-203ENSMUST00000216452 706 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm18040-201ENSMUST00000217922 827 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm30893-201ENSMUST00000220479 903 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 4931400O07Rik-201ENSMUST00000033537 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm9964-201ENSMUST00000068448 728 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Vmn1r202-201ENSMUST00000078642 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Mir138-2-201ENSMUST00000083578 71 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm23846-201ENSMUST00000083835 107 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm13304-201ENSMUST00000098123 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Olfr1044-201ENSMUST00000099906 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Ctage5-208ENSMUST00000175877 2612 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Sdcbp-202ENSMUST00000103008 2086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 A630072L19Rik-202ENSMUST00000221309 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Fbxw20-201ENSMUST00000079548 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm19801-201ENSMUST00000218231 1882 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm43022-201ENSMUST00000197067 4268 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Ugt1a6b-201ENSMUST00000113137 2249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm2035J3QP87 Gm4973-201ENSMUST00000206925 1334 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms