Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 4921539E11Rik-203ENSMUST00000168664 2356 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm37238-201ENSMUST00000195552 2390 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm10415-201ENSMUST00000204181 2825 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm26608-202ENSMUST00000181503 1362 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Ncoa7-212ENSMUST00000217644 2256 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm37137-201ENSMUST00000195138 2684 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Omd-202ENSMUST00000221170 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Ralgapa2-202ENSMUST00000109986 11030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Rsf1os2-202ENSMUST00000147690 3091 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Zfp974-201ENSMUST00000098639 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm11609-201ENSMUST00000121926 793 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Hmgb4os-201ENSMUST00000131581 518 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Scgn-202ENSMUST00000142826 470 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Mir1945-201ENSMUST00000157919 78 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm26353-201ENSMUST00000158224 255 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 4930448H16Rik-201ENSMUST00000159838 580 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm16102-201ENSMUST00000160955 420 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Olfr1252-201ENSMUST00000186710 1099 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 1810041H14Rik-202ENSMUST00000187218 434 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm37265-201ENSMUST00000191698 885 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm37491-201ENSMUST00000192552 1111 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm38237-201ENSMUST00000193366 376 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm43850-201ENSMUST00000202021 578 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm5318-201ENSMUST00000205249 406 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm18805-201ENSMUST00000206872 655 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm45267-201ENSMUST00000211028 522 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 E330011O21Rik-208ENSMUST00000211650 1225 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 4930567H12Rik-202ENSMUST00000212512 766 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 CT009748.2-201ENSMUST00000213828 1082 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 AC122188.1-201ENSMUST00000217534 312 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 4930455C13Rik-201ENSMUST00000218108 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 AC154563.1-201ENSMUST00000228317 442 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 1700109H08Rik-201ENSMUST00000008451 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Amy2a5-201ENSMUST00000098673 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm16513-202ENSMUST00000201663 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm43360-201ENSMUST00000197656 2887 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Olfr1281-202ENSMUST00000208176 4905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Olfr610-203ENSMUST00000217627 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Olfr55-204ENSMUST00000216633 4758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 2900079G21Rik-204ENSMUST00000163302 2764 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Samd12-201ENSMUST00000078673 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm37127-201ENSMUST00000192924 3036 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Papola-215ENSMUST00000170002 2605 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm5039-202ENSMUST00000218054 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Phospho2-206ENSMUST00000180290 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Mef2c-212ENSMUST00000197146 6088 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Cxcl11-202ENSMUST00000122808 3794 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Mecom-212ENSMUST00000173495 5066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Olfr78-204ENSMUST00000217123 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm37541-201ENSMUST00000192464 2315 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Smad2-203ENSMUST00000113930 1305 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Acvr1c-202ENSMUST00000100085 4289 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Rlf-203ENSMUST00000168615 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Lama2-207ENSMUST00000189575 4244 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 4930503H13Rik-201ENSMUST00000118320 725 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm22223-201ENSMUST00000157360 125 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm37974-201ENSMUST00000193668 220 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm43743-202ENSMUST00000198353 491 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm32754-201ENSMUST00000199442 257 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm44163-201ENSMUST00000205140 475 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Olfr396-ps1-202ENSMUST00000205791 633 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm45303-201ENSMUST00000211239 676 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm8637-201ENSMUST00000212919 1085 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm32105-201ENSMUST00000218512 511 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm7240-202ENSMUST00000221961 353 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 AC137902.1-201ENSMUST00000228184 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Emc2-201ENSMUST00000022962 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Olfr930-201ENSMUST00000058789 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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