Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Foxp1-206ENSMUST00000113326 7029 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r90-204ENSMUST00000226802 7185 ntAPPRIS P2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Skil-202ENSMUST00000117728 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm20750-201ENSMUST00000194274 3515 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Slu7-206ENSMUST00000178622 3566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Pde10a-206ENSMUST00000115720 3328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Selp-205ENSMUST00000162746 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Hbb-bh2-201ENSMUST00000106866 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Cd59b-202ENSMUST00000111130 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm11625-201ENSMUST00000119535 296 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm12583-201ENSMUST00000120677 853 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Smt3h2-ps-201ENSMUST00000121084 285 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Pttg1-206ENSMUST00000121638 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r-ps12-201ENSMUST00000176946 502 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 C130060C02Rik-201ENSMUST00000181731 1142 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm5946-201ENSMUST00000182340 970 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Kif4-ps-201ENSMUST00000184686 3665 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Ighv1-19-1-201ENSMUST00000192823 351 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm8826-201ENSMUST00000193161 948 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Ighv1-35-201ENSMUST00000195265 351 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm8942-201ENSMUST00000217892 400 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm40658-202ENSMUST00000221900 701 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 AC211878.2-201ENSMUST00000222486 488 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 CT956049.1-201ENSMUST00000225671 763 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Olfr1502-201ENSMUST00000074221 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Ska2-201ENSMUST00000020794 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm45221-201ENSMUST00000207822 2272 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Ncoa2-202ENSMUST00000068304 8006 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Usp7-207ENSMUST00000160405 4745 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Olfr1065-204ENSMUST00000217586 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Trp63-205ENSMUST00000115306 4691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 AC135119.1-204ENSMUST00000228036 2663 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Ide-201ENSMUST00000131070 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm43022-201ENSMUST00000197067 4268 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm14582-201ENSMUST00000141697 1189 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm15634-201ENSMUST00000147206 492 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm25427-201ENSMUST00000157605 103 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm6205-201ENSMUST00000165424 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Trav6-5-202ENSMUST00000183488 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Scgb1b34-ps-201ENSMUST00000187959 331 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm45356-201ENSMUST00000209274 823 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm45798-201ENSMUST00000212370 511 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Rpl17-ps2-201ENSMUST00000218101 532 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 AC164576.1-201ENSMUST00000218783 693 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Mir484-201ENSMUST00000093566 67 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Olfr688-201ENSMUST00000098155 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Hist1h2bb-201ENSMUST00000099703 508 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm45876-201ENSMUST00000212698 2709 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Zbed4-ps3-201ENSMUST00000187149 3244 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 D630023O14Rik-201ENSMUST00000191913 3099 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Kmo-201ENSMUST00000040250 2695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms