Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms