Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms