Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms