Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trip6Q9Z1Y4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms