Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1R4

D17h6s53e, Uncharacterized protein C6orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17h6s53eQ9Z1R4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
D17h6s53eQ9Z1R4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
D17h6s53eQ9Z1R4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
D17h6s53eQ9Z1R4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms