Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lgr5Q9Z1P4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lgr5Q9Z1P4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms