Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddx39bQ9Z1N5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ddx39bQ9Z1N5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ddx39bQ9Z1N5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ddx39bQ9Z1N5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ddx39bQ9Z1N5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ddx39bQ9Z1N5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ddx39bQ9Z1N5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ddx39bQ9Z1N5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx39bQ9Z1N5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx39bQ9Z1N5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx39bQ9Z1N5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx39bQ9Z1N5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx39bQ9Z1N5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx39bQ9Z1N5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx39bQ9Z1N5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx39bQ9Z1N5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx39bQ9Z1N5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx39bQ9Z1N5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx39bQ9Z1N5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx39bQ9Z1N5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx39bQ9Z1N5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx39bQ9Z1N5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx39bQ9Z1N5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx39bQ9Z1N5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx39bQ9Z1N5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx39bQ9Z1N5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx39bQ9Z1N5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx39bQ9Z1N5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx39bQ9Z1N5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx39bQ9Z1N5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx39bQ9Z1N5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddx39bQ9Z1N5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ddx39bQ9Z1N5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddx39bQ9Z1N5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddx39bQ9Z1N5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms