Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms