Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nek4Q9Z1J2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nek4Q9Z1J2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nek4Q9Z1J2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nek4Q9Z1J2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nek4Q9Z1J2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Nek4Q9Z1J2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nek4Q9Z1J2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nek4Q9Z1J2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nek4Q9Z1J2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nek4Q9Z1J2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nek4Q9Z1J2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nek4Q9Z1J2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nek4Q9Z1J2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nek4Q9Z1J2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nek4Q9Z1J2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms