Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1B8

Phf1, PHD finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf1Q9Z1B8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms