Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z7

Klf5, Krueppel-like factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf5Q9Z0Z7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Klf5Q9Z0Z7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf5Q9Z0Z7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf5Q9Z0Z7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms