Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0U0

Xpr1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xpr1Q9Z0U0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Xpr1Q9Z0U0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xpr1Q9Z0U0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xpr1Q9Z0U0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xpr1Q9Z0U0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Xpr1Q9Z0U0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms