Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp2Q9Z0E6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp2Q9Z0E6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp2Q9Z0E6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp2Q9Z0E6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp2Q9Z0E6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp2Q9Z0E6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp2Q9Z0E6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp2Q9Z0E6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp2Q9Z0E6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp2Q9Z0E6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp2Q9Z0E6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp2Q9Z0E6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp2Q9Z0E6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp2Q9Z0E6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp2Q9Z0E6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp2Q9Z0E6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp2Q9Z0E6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp2Q9Z0E6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp2Q9Z0E6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp2Q9Z0E6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp2Q9Z0E6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp2Q9Z0E6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp2Q9Z0E6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp2Q9Z0E6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp2Q9Z0E6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp2Q9Z0E6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp2Q9Z0E6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp2Q9Z0E6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp2Q9Z0E6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp2Q9Z0E6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp2Q9Z0E6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp2Q9Z0E6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp2Q9Z0E6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp2Q9Z0E6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp2Q9Z0E6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp2Q9Z0E6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp2Q9Z0E6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp2Q9Z0E6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp2Q9Z0E6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp2Q9Z0E6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp2Q9Z0E6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp2Q9Z0E6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp2Q9Z0E6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp2Q9Z0E6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp2Q9Z0E6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp2Q9Z0E6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp2Q9Z0E6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp2Q9Z0E6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp2Q9Z0E6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp2Q9Z0E6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp2Q9Z0E6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp2Q9Z0E6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp2Q9Z0E6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp2Q9Z0E6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp2Q9Z0E6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp2Q9Z0E6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp2Q9Z0E6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp2Q9Z0E6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp2Q9Z0E6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp2Q9Z0E6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp2Q9Z0E6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp2Q9Z0E6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp2Q9Z0E6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp2Q9Z0E6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp2Q9Z0E6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp2Q9Z0E6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp2Q9Z0E6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp2Q9Z0E6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp2Q9Z0E6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp2Q9Z0E6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp2Q9Z0E6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp2Q9Z0E6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp2Q9Z0E6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp2Q9Z0E6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp2Q9Z0E6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp2Q9Z0E6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp2Q9Z0E6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp2Q9Z0E6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp2Q9Z0E6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp2Q9Z0E6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp2Q9Z0E6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp2Q9Z0E6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp2Q9Z0E6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp2Q9Z0E6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp2Q9Z0E6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp2Q9Z0E6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp2Q9Z0E6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp2Q9Z0E6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp2Q9Z0E6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp2Q9Z0E6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp2Q9Z0E6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp2Q9Z0E6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbp2Q9Z0E6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbp2Q9Z0E6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbp2Q9Z0E6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbp2Q9Z0E6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbp2Q9Z0E6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbp2Q9Z0E6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbp2Q9Z0E6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms