Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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AireQ9Z0E3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AireQ9Z0E3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AireQ9Z0E3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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AireQ9Z0E3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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AireQ9Z0E3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AireQ9Z0E3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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AireQ9Z0E3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AireQ9Z0E3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AireQ9Z0E3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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AireQ9Z0E3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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AireQ9Z0E3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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AireQ9Z0E3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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AireQ9Z0E3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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AireQ9Z0E3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AireQ9Z0E3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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AireQ9Z0E3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AireQ9Z0E3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AireQ9Z0E3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AireQ9Z0E3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AireQ9Z0E3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AireQ9Z0E3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AireQ9Z0E3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AireQ9Z0E3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AireQ9Z0E3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AireQ9Z0E3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AireQ9Z0E3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AireQ9Z0E3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AireQ9Z0E3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AireQ9Z0E3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AireQ9Z0E3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AireQ9Z0E3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AireQ9Z0E3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AireQ9Z0E3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AireQ9Z0E3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AireQ9Z0E3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AireQ9Z0E3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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