Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pmfbp1Q9WVQ0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms