Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pacsin2Q9WVE8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pacsin2Q9WVE8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pacsin2Q9WVE8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pacsin2Q9WVE8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pacsin2Q9WVE8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pacsin2Q9WVE8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pacsin2Q9WVE8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Pacsin2Q9WVE8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pacsin2Q9WVE8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pacsin2Q9WVE8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms