Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnfsf13bQ9WU72 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnfsf13bQ9WU72 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnfsf13bQ9WU72 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnfsf13bQ9WU72 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnfsf13bQ9WU72 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnfsf13bQ9WU72 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnfsf13bQ9WU72 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnfsf13bQ9WU72 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnfsf13bQ9WU72 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnfsf13bQ9WU72 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnfsf13bQ9WU72 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnfsf13bQ9WU72 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnfsf13bQ9WU72 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnfsf13bQ9WU72 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnfsf13bQ9WU72 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnfsf13bQ9WU72 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnfsf13bQ9WU72 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnfsf13bQ9WU72 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnfsf13bQ9WU72 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms