Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema6cQ9WTM3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms