Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam50bQ9WTJ8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam50bQ9WTJ8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam50bQ9WTJ8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam50bQ9WTJ8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam50bQ9WTJ8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam50bQ9WTJ8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam50bQ9WTJ8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam50bQ9WTJ8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam50bQ9WTJ8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam50bQ9WTJ8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam50bQ9WTJ8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam50bQ9WTJ8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam50bQ9WTJ8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam50bQ9WTJ8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam50bQ9WTJ8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam50bQ9WTJ8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam50bQ9WTJ8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam50bQ9WTJ8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam50bQ9WTJ8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam50bQ9WTJ8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam50bQ9WTJ8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam50bQ9WTJ8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam50bQ9WTJ8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam50bQ9WTJ8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam50bQ9WTJ8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam50bQ9WTJ8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam50bQ9WTJ8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam50bQ9WTJ8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam50bQ9WTJ8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam50bQ9WTJ8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam50bQ9WTJ8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam50bQ9WTJ8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam50bQ9WTJ8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam50bQ9WTJ8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam50bQ9WTJ8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam50bQ9WTJ8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam50bQ9WTJ8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam50bQ9WTJ8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam50bQ9WTJ8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam50bQ9WTJ8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms