Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slit2Q9R1B9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slit2Q9R1B9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slit2Q9R1B9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slit2Q9R1B9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slit2Q9R1B9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slit2Q9R1B9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slit2Q9R1B9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slit2Q9R1B9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Slit2Q9R1B9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slit2Q9R1B9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slit2Q9R1B9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slit2Q9R1B9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slit2Q9R1B9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slit2Q9R1B9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slit2Q9R1B9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slit2Q9R1B9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slit2Q9R1B9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slit2Q9R1B9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slit2Q9R1B9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slit2Q9R1B9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slit2Q9R1B9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slit2Q9R1B9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slit2Q9R1B9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slit2Q9R1B9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slit2Q9R1B9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slit2Q9R1B9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slit2Q9R1B9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slit2Q9R1B9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slit2Q9R1B9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slit2Q9R1B9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slit2Q9R1B9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slit2Q9R1B9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slit2Q9R1B9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slit2Q9R1B9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slit2Q9R1B9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Slit2Q9R1B9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slit2Q9R1B9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slit2Q9R1B9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Slit2Q9R1B9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slit2Q9R1B9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slit2Q9R1B9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slit2Q9R1B9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slit2Q9R1B9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slit2Q9R1B9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slit2Q9R1B9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slit2Q9R1B9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Slit2Q9R1B9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Slit2Q9R1B9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slit2Q9R1B9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms