Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms