Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M5

Tpk1, Thiamin pyrophosphokinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpk1Q9R0M5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpk1Q9R0M5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tpk1Q9R0M5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms