Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms