Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Prkab1Q9R078 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prkab1Q9R078 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Prkab1Q9R078 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Prkab1Q9R078 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Prkab1Q9R078 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Prkab1Q9R078 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Prkab1Q9R078 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prkab1Q9R078 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prkab1Q9R078 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prkab1Q9R078 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prkab1Q9R078 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prkab1Q9R078 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prkab1Q9R078 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prkab1Q9R078 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prkab1Q9R078 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prkab1Q9R078 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prkab1Q9R078 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prkab1Q9R078 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prkab1Q9R078 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prkab1Q9R078 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prkab1Q9R078 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prkab1Q9R078 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prkab1Q9R078 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prkab1Q9R078 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prkab1Q9R078 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prkab1Q9R078 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms