Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms