Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

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Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col4a3Q9QZS0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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