Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Npas3Q9QZQ0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms