Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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Usp21Q9QZL6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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Usp21Q9QZL6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp21Q9QZL6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp21Q9QZL6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp21Q9QZL6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp21Q9QZL6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp21Q9QZL6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp21Q9QZL6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp21Q9QZL6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp21Q9QZL6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp21Q9QZL6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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Usp21Q9QZL6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp21Q9QZL6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp21Q9QZL6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
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Usp21Q9QZL6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp21Q9QZL6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
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Usp21Q9QZL6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp21Q9QZL6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp21Q9QZL6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp21Q9QZL6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp21Q9QZL6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp21Q9QZL6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp21Q9QZL6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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Usp21Q9QZL6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp21Q9QZL6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp21Q9QZL6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp21Q9QZL6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp21Q9QZL6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp21Q9QZL6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp21Q9QZL6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp21Q9QZL6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp21Q9QZL6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp21Q9QZL6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp21Q9QZL6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp21Q9QZL6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp21Q9QZL6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp21Q9QZL6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp21Q9QZL6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp21Q9QZL6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp21Q9QZL6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp21Q9QZL6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp21Q9QZL6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp21Q9QZL6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp21Q9QZL6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp21Q9QZL6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp21Q9QZL6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp21Q9QZL6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp21Q9QZL6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp21Q9QZL6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp21Q9QZL6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms