Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYR6

Map1a, Microtubule-associated protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 2,776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map1aQ9QYR6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Map1aQ9QYR6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms