Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cbx8Q9QXV1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms