Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apbb1Q9QXJ1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Apbb1Q9QXJ1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apbb1Q9QXJ1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apbb1Q9QXJ1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apbb1Q9QXJ1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apbb1Q9QXJ1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Apbb1Q9QXJ1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apbb1Q9QXJ1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms