Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWH1

Phc2, Polyhomeotic-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 850 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc2Q9QWH1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phc2Q9QWH1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phc2Q9QWH1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phc2Q9QWH1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phc2Q9QWH1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phc2Q9QWH1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phc2Q9QWH1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phc2Q9QWH1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phc2Q9QWH1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phc2Q9QWH1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phc2Q9QWH1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phc2Q9QWH1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phc2Q9QWH1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phc2Q9QWH1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phc2Q9QWH1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phc2Q9QWH1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phc2Q9QWH1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phc2Q9QWH1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phc2Q9QWH1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phc2Q9QWH1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phc2Q9QWH1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phc2Q9QWH1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phc2Q9QWH1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phc2Q9QWH1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phc2Q9QWH1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phc2Q9QWH1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phc2Q9QWH1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phc2Q9QWH1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phc2Q9QWH1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phc2Q9QWH1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phc2Q9QWH1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phc2Q9QWH1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phc2Q9QWH1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Phc2Q9QWH1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phc2Q9QWH1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phc2Q9QWH1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phc2Q9QWH1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phc2Q9QWH1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phc2Q9QWH1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phc2Q9QWH1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phc2Q9QWH1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phc2Q9QWH1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phc2Q9QWH1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Phc2Q9QWH1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Phc2Q9QWH1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Phc2Q9QWH1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms