Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms