Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cdkl2Q9QUK0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms