Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUI0

Rhoa, Transforming protein RhoA, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoaQ9QUI0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RhoaQ9QUI0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RhoaQ9QUI0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RhoaQ9QUI0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RhoaQ9QUI0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RhoaQ9QUI0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RhoaQ9QUI0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RhoaQ9QUI0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RhoaQ9QUI0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RhoaQ9QUI0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RhoaQ9QUI0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RhoaQ9QUI0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RhoaQ9QUI0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RhoaQ9QUI0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RhoaQ9QUI0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RhoaQ9QUI0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RhoaQ9QUI0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RhoaQ9QUI0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RhoaQ9QUI0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RhoaQ9QUI0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RhoaQ9QUI0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RhoaQ9QUI0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RhoaQ9QUI0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RhoaQ9QUI0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RhoaQ9QUI0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RhoaQ9QUI0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RhoaQ9QUI0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RhoaQ9QUI0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RhoaQ9QUI0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RhoaQ9QUI0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RhoaQ9QUI0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RhoaQ9QUI0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RhoaQ9QUI0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RhoaQ9QUI0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RhoaQ9QUI0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RhoaQ9QUI0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RhoaQ9QUI0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RhoaQ9QUI0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RhoaQ9QUI0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RhoaQ9QUI0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RhoaQ9QUI0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RhoaQ9QUI0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RhoaQ9QUI0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RhoaQ9QUI0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RhoaQ9QUI0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms