Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Hdgfl3Q9JMG7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Hdgfl3Q9JMG7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Hdgfl3Q9JMG7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Hdgfl3Q9JMG7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Hdgfl3Q9JMG7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Hdgfl3Q9JMG7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdgfl3Q9JMG7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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