Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ap3b2Q9JME5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ap3b2Q9JME5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ap3b2Q9JME5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ap3b2Q9JME5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ap3b2Q9JME5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ap3b2Q9JME5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ap3b2Q9JME5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ap3b2Q9JME5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ap3b2Q9JME5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ap3b2Q9JME5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ap3b2Q9JME5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ap3b2Q9JME5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ap3b2Q9JME5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ap3b2Q9JME5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ap3b2Q9JME5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ap3b2Q9JME5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ap3b2Q9JME5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ap3b2Q9JME5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ap3b2Q9JME5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ap3b2Q9JME5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ap3b2Q9JME5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ap3b2Q9JME5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ap3b2Q9JME5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ap3b2Q9JME5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ap3b2Q9JME5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ap3b2Q9JME5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ap3b2Q9JME5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ap3b2Q9JME5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ap3b2Q9JME5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ap3b2Q9JME5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ap3b2Q9JME5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ap3b2Q9JME5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ap3b2Q9JME5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ap3b2Q9JME5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ap3b2Q9JME5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ap3b2Q9JME5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ap3b2Q9JME5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ap3b2Q9JME5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ap3b2Q9JME5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ap3b2Q9JME5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ap3b2Q9JME5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ap3b2Q9JME5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ap3b2Q9JME5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ap3b2Q9JME5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ap3b2Q9JME5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ap3b2Q9JME5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ap3b2Q9JME5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ap3b2Q9JME5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ap3b2Q9JME5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ap3b2Q9JME5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ap3b2Q9JME5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ap3b2Q9JME5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ap3b2Q9JME5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ap3b2Q9JME5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ap3b2Q9JME5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ap3b2Q9JME5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ap3b2Q9JME5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ap3b2Q9JME5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ap3b2Q9JME5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ap3b2Q9JME5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ap3b2Q9JME5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ap3b2Q9JME5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ap3b2Q9JME5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ap3b2Q9JME5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ap3b2Q9JME5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ap3b2Q9JME5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ap3b2Q9JME5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ap3b2Q9JME5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ap3b2Q9JME5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ap3b2Q9JME5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ap3b2Q9JME5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ap3b2Q9JME5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ap3b2Q9JME5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ap3b2Q9JME5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ap3b2Q9JME5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ap3b2Q9JME5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ap3b2Q9JME5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ap3b2Q9JME5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ap3b2Q9JME5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ap3b2Q9JME5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ap3b2Q9JME5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ap3b2Q9JME5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ap3b2Q9JME5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ap3b2Q9JME5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ap3b2Q9JME5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ap3b2Q9JME5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ap3b2Q9JME5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ap3b2Q9JME5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ap3b2Q9JME5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ap3b2Q9JME5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ap3b2Q9JME5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ap3b2Q9JME5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ap3b2Q9JME5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ap3b2Q9JME5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ap3b2Q9JME5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ap3b2Q9JME5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ap3b2Q9JME5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ap3b2Q9JME5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ap3b2Q9JME5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms