Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMA7

Cyp3a41a, Cytochrome P450 3A41, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a41aQ9JMA7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms