Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMA2

Qtrt1, Queuine tRNA-ribosyltransferase catalytic subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Qtrt1Q9JMA2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Qtrt1Q9JMA2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Qtrt1Q9JMA2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Qtrt1Q9JMA2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Qtrt1Q9JMA2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Qtrt1Q9JMA2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Qtrt1Q9JMA2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Qtrt1Q9JMA2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Qtrt1Q9JMA2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Qtrt1Q9JMA2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Qtrt1Q9JMA2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Qtrt1Q9JMA2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Qtrt1Q9JMA2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Qtrt1Q9JMA2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Qtrt1Q9JMA2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Qtrt1Q9JMA2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Qtrt1Q9JMA2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Qtrt1Q9JMA2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Qtrt1Q9JMA2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Qtrt1Q9JMA2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Qtrt1Q9JMA2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Qtrt1Q9JMA2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Qtrt1Q9JMA2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Qtrt1Q9JMA2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Qtrt1Q9JMA2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Qtrt1Q9JMA2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Qtrt1Q9JMA2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Qtrt1Q9JMA2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Qtrt1Q9JMA2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Qtrt1Q9JMA2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Qtrt1Q9JMA2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Qtrt1Q9JMA2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Qtrt1Q9JMA2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Qtrt1Q9JMA2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Qtrt1Q9JMA2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Qtrt1Q9JMA2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Qtrt1Q9JMA2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Qtrt1Q9JMA2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Qtrt1Q9JMA2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Qtrt1Q9JMA2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Qtrt1Q9JMA2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Qtrt1Q9JMA2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms