Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prg4Q9JM99 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prg4Q9JM99 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prg4Q9JM99 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prg4Q9JM99 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prg4Q9JM99 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prg4Q9JM99 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Prg4Q9JM99 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prg4Q9JM99 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prg4Q9JM99 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prg4Q9JM99 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prg4Q9JM99 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prg4Q9JM99 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prg4Q9JM99 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prg4Q9JM99 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prg4Q9JM99 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prg4Q9JM99 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prg4Q9JM99 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prg4Q9JM99 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prg4Q9JM99 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prg4Q9JM99 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prg4Q9JM99 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prg4Q9JM99 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prg4Q9JM99 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prg4Q9JM99 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prg4Q9JM99 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Prg4Q9JM99 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prg4Q9JM99 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Prg4Q9JM99 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prg4Q9JM99 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prg4Q9JM99 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prg4Q9JM99 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prg4Q9JM99 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prg4Q9JM99 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prg4Q9JM99 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prg4Q9JM99 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prg4Q9JM99 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prg4Q9JM99 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prg4Q9JM99 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prg4Q9JM99 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prg4Q9JM99 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms